validation / pointmets

Commit 7aacb90f511280bcb1982d2994c0e701b178869c

Authored by David Mayerich
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... ... @@ -16,6 +16,9 @@ find_package(ANN REQUIRED)
16 16 #find the pthreads package
17 17 find_package(Threads)
18 18  
  19 +#find the X11 package
  20 +find_package(X11)
  21 +
19 22 include_directories(
20 23 ${STIM_INCLUDE_DIRS}
21 24 ${ANN_INCLUDE_DIR}
... ... @@ -35,6 +38,7 @@ add_executable(pointmets
35 38 target_link_libraries(pointmets
36 39 ${CMAKE_THREAD_LIBS_INIT}
37 40 ${ANN_LIBRARY}
  41 + ${X11_LIBRARIES}
38 42 )
39 43  
40 44 #copy an OBJ test case
... ...
data/blue_gt.txt
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3   -46 587
4   -57 785
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210 210 1852 381
211 211 \ No newline at end of file
... ...
main.cpp
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... ... @@ -107,14 +107,14 @@ void calc_hitlist(std::vector< unsigned int >& hits,
107 107  
108 108 int main(int argc, char** argv){
109 109  
110   - //output advertisement
111   - std::cout<<std::endl<<std::endl;
112   - std::cout<<"========================================================================="<<std::endl;
113   - std::cout<<"Thank you for using the PointMets validation tool!"<<std::endl;
114   - std::cout<<"Scalable Tissue Imaging and Modeling (STIM) Lab, University of Houston"<<std::endl;
115   - std::cout<<"Developers: David Mayerich"<<std::endl;
116   - std::cout<<"Source: https://github.com/stimlab/hsiproc.git"<<std::endl;
117   - std::cout<<"========================================================================="<<std::endl<<std::endl;
  110 + //output advertisement
  111 + std::cout<<std::endl<<std::endl;
  112 + std::cout<<"========================================================================="<<std::endl;
  113 + std::cout<<"Thank you for using the PointMets validation tool!"<<std::endl;
  114 + std::cout<<"Scalable Tissue Imaging and Modeling (STIM) Lab, University of Houston"<<std::endl;
  115 + std::cout<<"Developers: David Mayerich"<<std::endl;
  116 + std::cout<<"Source: https://git.stim.ee.uh.edu/validation/pointmets"<<std::endl;
  117 + std::cout<<"========================================================================="<<std::endl<<std::endl;
118 118  
119 119  
120 120 stim::arglist args;
... ... @@ -131,20 +131,20 @@ int main(int argc, char** argv){
131 131 args.parse(argc, argv);
132 132  
133 133 //display the help text if requested
134   - if(args["help"].is_set()){
135   - std::cout<<std::endl<<"usage: pointmets ground_truth test_case --option [A B C ...]"<<std::endl;
136   - std::cout<<std::endl<<std::endl
137   - << "examples: pointmets blue_gt.txt blue_t.txt"<<std::endl;
138   - std::cout << " pointmets blue_gt.bmp blue_t.bmp" << std::endl;
139   - std::cout<<std::endl<<std::endl;
140   - std::cout<<args.str()<<std::endl;
141   - exit(1);
  134 + if(args["help"].is_set()){
  135 + std::cout<<std::endl<<"usage: pointmets ground_truth test_case --option [A B C ...]"<<std::endl;
  136 + std::cout<<std::endl<<std::endl
  137 + << "examples: pointmets blue_gt.txt blue_t.txt"<<std::endl;
  138 + std::cout << " pointmets blue_gt.bmp blue_t.bmp" << std::endl;
  139 + std::cout<<std::endl<<std::endl;
  140 + std::cout<<args.str()<<std::endl;
  141 + exit(1);
142 142 }
143 143  
144   - //if the input and output files aren't specified, throw an error and exit
145   - if(args.nargs() < 2){
146   - std::cout<<"ERROR: Two files must be specified for comparison, enter pointmets --help for options."<<std::endl<<std::endl;
147   - exit(1);
  144 + //if the input and output files aren't specified, throw an error and exit
  145 + if(args.nargs() < 2){
  146 + std::cout<<"ERROR: Two files must be specified for comparison, enter pointmets --help for options."<<std::endl<<std::endl;
  147 + exit(1);
148 148 }
149 149  
150 150 //get the ground truth and test file
... ...